El sistema hidrográfico de la comuna esta compuesto por:

EL RÍO ITATA: Que corre de sur a norte y constituye el limite oriental de la comuna.

ESTERO COYANCO: Corre de poniente a oriente, al norte de la comuna, hasta desembocar en el río Itata.

ESTERO QUILLÓN´: Corre de sur a norte, bordeando las estribaciones de la cordillera de la costa, hasta desembocar en la parte final del estero Coyanco.

LAGUNA AVENDAÑO:  Situada al norte de la comuna junto al río Itata y surtida por napas subterráneas, debido a la ausencia de cursos superficiales que desemboquen en ella.

LAGUNA LOS LITRES:  Ubicada al sur de la comuna, pertenece a la hoya hidrográfica del río Claro que nace en la comuna y corre de norte a sur.